1. 准备工作

● 查阅文献

● 做好样品前处理，萃取浓缩分离纯化

● 有条件的可先在HPLC上摸好LC条件，能够基本分离更好，缓冲体系符合MS要求

● 溶剂包括水的纯度，最好色谱纯以上

● 新的色谱柱可能要先冲洗很长时间才能干净,某些样品非常容易吸附在进样阀和管路中，用溶剂清洗

● 质谱仪须校准，预热时间要足够长，气流的稳定也很重要，液N气阀开度要注意，达到稳定程度

2. MS条件优化——先定性后定量

● 首先，确定离子化方式：

ESI or APCI，POS or NEG

● 用10-100ppm的纯样，Q1 SCAN 察看存在哪些离子，要能够看到待测的母离子，应明显比周围的噪声离子高，通过改变DP,观察离子的增减,若为POS方式，看M+1，M+18，M+23等等,初步判断分子离子,如看不到则可能是浓度太低或离子化方式不合适，或选择的溶剂体系不合适

● 母离子选M+H,或M-H最好,但有时只有M+NH4,M+Na等,这样CAD能量可能需要高些,选择[M+H]+，还是+NH4，+Na等，要由化合物决定。加合离子若稳定，则可用，不稳定则可能需换流动相，但+H通常好些，所需碰撞能量低，灵敏度高；如含Cl可选择2个母离子峰

● SIM与MRM，单级Q只能SIM，MRM可看成2个SIM，选择性更好

● 再根据上一步确定的母离子进行PRODUCT SCAN，确保所有碎片离子都来自待测化合物，而不是溶液中的杂质，找出较强的碎片离子信息。还可改变CE，从中选定MRM需要测定的一对或更多离子对,为最后LC-MS/MS联用做准备

● 做PRODUCT SCAN时，注意小数点后的位数,MRM输入要准,灵敏度才高

● 先多选几个离子对，待出现基质干扰时可换，最后根据法规要求确定离子对数目

● MRM方式优化仪器，通过优化仪器参数，使得母、子离子都达到一定强度水平，使MRM灵敏度最高。可先让仪器自动优化参数，然后再手动细致优化，只检测一对离子时根据TIC的强度来确定仪器参数，一次优化多对离子时，要根据每对离子的XIC强度来分别确定仪器参数

● 先用注射泵优化COMPOUND项下面的参数，如DP、CE及CAD等，再接通LC，用FIA优化其他参数如温度，气流和IS电压及离子源位置，或接一个三通，样品仍由注射泵进入离子源，同时LC保持需要的流量. 然后进行MRM测定。

● CURTAIN GAS在不降低灵敏度情况下尽量大些，雾化辅助加热气流不用太大，这样可以提高信噪比，保持信号稳定。

● 分辨率的选择：当样品较纯，Q3可选LOW，提高灵敏度，若选LOW后本底噪声太高则意义不大。

3. LC条件优化

● 色谱柱长度可根据分离的要求而定，定性可长些,定量在能有效排除干扰情况下尽量短,提高效率；内径最好选细径柱如2mm的,1mm的,IS可不分流, 4.6mm柱用1ml流量时如不分流灵敏度还不是最佳,不如流量低时更好。流速高，峰形好

● 不同牌号色谱柱，效果很可能不同

● PH的影响-正离子方式PH要低些，负离子方式PH要高些，除对离子化有影响外，还影响LC的峰形，以至定量误差。流动相加乙酸铵可适合大部分测定要求

● 用流动相配的标样，初步优化确定LC条件是否合适

● 标准品工作液现配现做，尤其是较低浓度，时间长了可能因吸附分解等降低

● 进样顺序要先稀后浓

● 洗针液要常换，进过浓样后要进一针空白，检验是否有残留污染

● 顺序：纯样-添加样-实际样品

● 流动相液优化后，空白提取液配制标准再优化，看干扰，空白添加再提取后看回收率

● 用空白提取液配制标准样做曲线，准确，有效排除干扰因素

前处理方法的优化

● LC，MS都优化还不行，改提取方法

● 离子抑制-改变前处理方法或LC条件

● 内标用法，药代动力学时多采用内标，选择原则：内标物与被测物的化学性质有区别时，要注意干扰基质对他们的离子化影响的不同，尽量选同系物。还可利用同位素标记

● 衍生化：有时有助于信号强，且稳定，例如硝基呋喃类，衍生化后容易测量。

4. 数据处理

● 最低检出限，信噪比～3:1，定量限～10:1

● 同一物质几对离子的比例应相对恒定，误差不超过15%，峰面积比峰高准确

● 当浓度低，信号弱，自动积分不准时可对峰面积手动积分

● 平滑次数与峰宽因子、保留时间等设置都会影响积分值

● 曲线过零点时，可用4个点；不用，则要5个点

● 线性范围太宽，有时意义不大