引言

微生物鉴定是指借助现有的分类系统，通过对未知微生物的特征测定，对其进行细菌、酵母菌和霉菌大类的区分，或属、种及菌株水平确定的过程。

通过微生物鉴定建立环境污染菌、供试品检出菌的微生物数据库，可用于制定洁净室/区消毒灭菌程序、供试品检出菌相关性分析、污染溯源、以及确定是否重试的重要判定依据等，对保证产品质量和无菌检查结果的可靠性具有重要意义。

微生物鉴定的基本程序包括分离纯化和鉴定。鉴定时，一般先将待检菌进行初步的分类。鉴定的方法有表型微生物鉴定和基因型微生物鉴定，根据所需达到的鉴定水平选择鉴定方法。

表型微生物鉴定

表型微生物鉴定依据表型特征的表达来区分不同微生物间的差异，是经典的微生物分类鉴定法，以微生物细胞的形态和习性表型为主要指标，通过比较微生物的菌落形态、理化特征和特征化学成分与典型微生物的差异进行鉴别。

微生物分类中常用的表型特征见下表：

      表型微生物鉴定通常需要大量的纯培养物，而微生物的恢复、增殖和鉴定易受培养时间影响，事实上许多环境微生物在普通的微生物增殖培养基中是无法恢复的，此外，—些从初始培养物中刚分离出的受损微生物还可能不能完整地表达其表型属性。因此，在表型鉴定时应注意采用的培养基、培养时间和传代次数对鉴定结果的影响。

基因型微生物鉴定

      与表型特征不同，微生物基因型通常不受生长培养基或分离物活性的影响，只需分离到纯菌落便可用于分析。由于大部分微生物物种中核酸序列是高度保守的，所以基因型微生物鉴定方法理论上更值得信赖。基因鉴定法通常在无菌检查试验结果阳性、非无菌药品控制菌检查中疑似菌的鉴定、环境监控异常、偏差调查、培养基模拟灌装失败等微生物偏差调查中使用。 

      目前《伯杰氏系统细菌学手册》中对细菌分类的描述是通过遗传物质的分析比较来实现的。系统发育典型的分析方法通过比较细菌16S rRNA基因、真菌18S rRNA基因、ITS 区域碱基序列来实现，然后与经验证过的专用数据库或利用公共数据库进行比对。

      同一地点的同种菌，其表型特征和基因型特征是基本一致的。不同地点的同种菌，表型特征可能基本一致，但保守及可变区域的基因特征会有一定的差异性。因此，污染调查等应以基因型特征鉴定为主，表型特征鉴定为辅。

      基因型微生物鉴定在医药产品的生产过程微生物污染控制中的作用越来越重要，为规范和指导医药生产和检验过程中的微生物鉴定工作，《中国药典》2020年版新增订3个基因型微生物鉴定相关通则：通则1021《细菌DNA特征序列鉴定法》、通则9108《DNA测序技术指导原则》、通则9109《标准核酸序列建立指导原则》。

出于建立、维护成本及技术难度的考虑，很少有企业实验室在内部配置基因型检测系统，当出现微生物鉴定需求时，通常会考虑选择合格供应商。

药明康德医疗器械测试中心拥有全球领先的基因型微生物快速鉴定系统，具有以下特点：

准确：基因型鉴定方法，满足各国药典要求。

快速：得到细菌/真菌的单菌落后，5小时轻松完成鉴定，检测通量大。

方便：广泛验证的细菌和真菌数据库，已购买数据库中包含2100种细菌和1114种真菌的序列信息。

合规：完成符合ICH和21CFR part 11要求的IQ/OQ/CSV验证。