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人肿瘤lncRNA PCR芯片


  • PCR ARRAY介绍

    PCR ARRAY又称PCR芯片,运用高通量荧光定量PCR方法,在一张96孔或384孔板上同时对某个信号通路或疾病相关基因的表达量变化进行检测,芯片上的基因包括了与研究对象有确定关系的基因或者待考证的基因;目前启因生物针对不同的信号通路和疾病相关基因设计了150多款功能分类PCR芯片,涵盖生命科学研究的各个领域。

    人肿瘤lncRNA PCR芯片介绍

    启因生物的人肿瘤lncRNA PCR ARRAY含有84个人肿瘤lncRNA 相关基因,包括:乳腺癌,肺癌,卵巢癌,神经母细胞瘤,黑色素瘤,胆囊癌等数十种肿瘤或癌症类型。

    产品说明

    产品名称

    肿瘤lncRNA PCR芯片

    英文名称

    Human Glucose Metabolism PCR Array

    货    号

    sp-TWCPAHM-0011

    基因数目

    84

    基因名称

    见基因列表

    检测费用

    800/样(活动价)

    样本类型

    细胞,组织等

    项目周期

    2周(不含节假日)

    实验结果

    原始数据,数据分析

    技术原理

    *相对定量,SYBR Green

    *相对定量:用于测定一个测试样本中目标基因与校正样本中同一基因表达的相对变化。校正样本可以是一个未经处理的对照或者是在一个实验研究中处于零时的样本

    服务特点

    1. 只需提供样品

    2. 数据分析多样性选择

    3. 中低通量,一次性检测多个相关基因的表达水平

    4. 周期短

    5. 结果不需要qPCR验证

    服务流程

    1. 确定实验方案,签合同

    2. 样品寄出(-80℃顺丰寄出)

    3. 收样后进行质控

    4. 质控过关,上机检测

    5. 数据分析

    样品预处理方法

    为了避免样品中RNA降解,需对样品进行预处理。

    样品类型

    处理方法

    送样量

    贴壁细胞

    倒出培养液,用 1×PBS 清洗一次。
    10 cm2生长的培养细胞中加入 1-2 ml trizol,轻微晃动,确保使裂解液均匀分布于细胞表面。将内含细胞的裂解液转移至离心管中-80℃保存

    至少1×106个细胞

    悬浮细胞

    将悬浮培养细胞连同培养液一起倒入离心管中,8,000 g 4℃离心2 分钟,弃上清。
    向细胞中加入 1 ml trizol-80℃保存

    至少1×106个细胞

    组织(动物器官类)

    离心管中加1 ml trizol,确保浸没组织,-80℃保存

    至少20mg,约小黄豆大小


    检测流程:

    1. 样品总RNA提取

    2. RNA质量检测,检测RNA纯度及完整度,提供RNA质量报告;

    3. cDNA合成,使用逆转录酶,将样品RNA逆转录为cDNA

    4. 实时定量PCR反应;

    5. 数据分析,计算PCR芯片中的各个Ct值,采用ΔΔCt方法比较基因的表达变化,并利用公司自主开发的数据分析软件进行比较。


    数据图

    火山图——是在一张图中利用P值和表达差异值分析做图,可以非常的直观且合理地筛选出在两样本间发生差异表达的基因。

    维恩图——不同的实验组(集合)之间的基因的相互关系。

    柱状图——能够直观的反映不同样本的基因表达情况的差异。

    散点图——用两组数据构成多个坐标点,考察坐标点的分布,判断两变量之间是否存在某种关联或总结坐标点的分布模式。

    热图——热图是对实验数据分布情况进行分析的直观可视化方法,可以用来进行实验数据的质量控制和差异数据的具像化展示,还可以对数据和样品进行聚类,观测样品质量。


    基因列表

    7SK

    DAOA-AS1

    IGF2-AS

    PCAT19

    7SL

    DGCR5

    IPW

    PCGEM1

    ASFMR1

    DISC2

    KCNQ1DN

    PDZRN3-AS1

    ATP6V1G2-DDX39B

    DLEU1

    KCNQ1OT1

    PISRT1

    ATXN8OS

    DLEU2

    LINC00032

    PRINS

    BACE1-AS

    DLX6-AS1

    LINC00162

    PTCSC1

    BCAR4

    DNM3OS

    LINC00271

    PVT1

    BCYRN1

    DSCAM-AS1

    LSAMP-AS3

    RMST

    BDNF-AS1

    EPB41L4A-AS1

    MALAT1

    SCAANT1

    BOK-AS1

    ESRG

    MEG3

    SNHG11

    BPESC1

    FMR4

    MESTIT1

    SNHG3

    CASC2

    GAS5

    MIAT

    SNHG4

    CBR3-AS1

    GDNFOS

    MIR100HG

    SNHG5

    CCAT1

    H19

    MIR155HG

    SOX2-OT

    CDKN2B-AS1

    HAR1A

    MIR17HG

    SPRY4-IT1

    CECR3

    HAR1B

    MKRN3-AS1

    SRA1

    CECR9

    HIF1A-AS1

    MYCNOS

    TCL6

    CERNA2

    HOTAIR

    NAMA

    TDRG1

    CHL1-AS2

    HOXA11-AS

    NEAT1

    TERC

    CRNDE

    HYMAI

    PCA3

    TP53COR1

    CUDR

    IFNG-AS1

    PCAT1

    TRAF3IP2-AS1


    更多芯片基因列表可上www.pcrarray.cn查询


    参考文献

    Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276. (IF9.661)

    Zheng H S, Guo W Q, Wu Q L, et al. Electro-peroxone pretreatment for enhanced simulated hospital wastewater treatment and antibiotic resistance genes reduction[J]. Environment international, 2018, 115: 70-78. (IF7.088)

    Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: In situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2018, 344: 441-449.IF6.065

    公司地址:

    城北路1355号上海大学科技园A901

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  • 检测案例
  • 2019-03-20
  • 医学检验