图：researchgate
qPCR实验结果的呈现通常采用柱状图的形式，一张典型的qPCR实验柱状图通常包括5个元素：X轴、Y轴、柱子、误差线、显著性标记。
如何阅读，有什么注意事项，今天的文章简要讲讲。
1 如何阅读
先看X轴信息，这里的分组代表了不同的实验组别，常见的分组有：对照组vs实验组，或者不同基因、不同时间、不同样本来源的分组。
图：PLOS
再看Y轴，Y轴代表基因的表达量。
如果X轴有对照组，那Y轴就代表该基因的相对表达量。对照组的存在，说明这个qPCR实验采用了相对定量的分析方法，所以他的数据是归一化后的比值。
对照组所对应的Y轴数值通常为1或者100%（下图），因为它是被作为参照物的，实验组>1，代表实验组的基因表达提高了，反之亦然。
图：GitHub
看完X和Y轴，就可以看柱子了。每个实验组对应一个柱子，柱子的高度就是基因的相对表达量。这个柱子的高度来自该实验组的多次实验的平均值。
每次实验得到的数字几乎不可能都一样，所以我们需要知道操作者每次实验的结果偏差有多大。偏差越大，代表这个实验每一次的结果越不稳定，它所得出的结论也越可疑。
如何用直观的符号表示这种批次的差异？用误差线，见下图红色框所示。
图：researchgate
每一根柱子上方延伸的竖线，代表该组数据的离散程度。误差线长度越长，说明该组数据内的数值大小的波动范围越大。
最后就是看显著性标记。它通常出现在两个柱子之间，用一条横线+星号（*）表示。它代表的是统计学上的差异，有4种统计学差异：*、**、***和ns。分别代表：
前3个都代表两组数据之间有显著差异，这种差异不是由偶然因素造成的，具有统计学意义。ns则说明尽管两组数据有差异，但差异不明显，两者间的差异可能是由于误差、样本本身的特异性造成的。
2 注意事项
读柱状图时，除了上述5个基本上要素以外，还需要注意几个细节。以下我们讲讲注意事项。
a 图表的说明文字（柱状图下方），会标注误差线所代表的含义以及实验重复次数。
如果误差线所代表的是SEM，说明这个柱子的误差线大小代表的是标准误差，如果是SD，则代表是标准差，它们之间的关系见下图公式。
两者的关系解释起来会比较抽象，大家在这里可以简单的去认为：当实验样本越多，SEM越能反映数据的真实离散程度，但相应的，实验成本也会越高。大多数实验论文会取一个平衡——也就是“经费在燃烧，差不多得了”。
上图，提示它的实验重复了5次，这5次是生物学重复，而非实验技术重复。这一点很重要，如果你只是拿了同样的一份样本，重复测了5次，那这组数据不能反映出个体差异，不能用于计算差异性。
b 注意Y轴的单位，看清楚它是线性尺度和还是对数尺度，后者会压缩柱子间的高低差异。
如果实验结果里有个别的柱子的数据差异特别大，作者就可能会采用对数尺度来显示Y轴数据，这样让整个图的每个柱子的高度看起来不会那么差异巨大——显得比较美观。
像上图采用Log2的数值尺度，Y轴的3就相当于8倍的差异了。
最后，总结一下今天的内容：看柱状图，先看X轴和Y轴，了解清楚实验分组和数据所代表的含义，然后看误差线，判断数据可靠性如何，最后看星号，分析实验结果所代表的含义。
